More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1808 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  84.5 
 
 		 489 aa  816    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  89.86 
 
 		 448 aa  822    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  86.52 
 
 		 448 aa  800    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 475 aa  956    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  58.33 
 
 		 460 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  57.24 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  43.88 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  43.49 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  43.73 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  41.44 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  38.57 
 
 		 514 aa  280  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.69 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  37.96 
 
 		 514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  38.82 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  41.49 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  43.39 
 
 		 376 aa  269  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  41.5 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  39.07 
 
 		 514 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  40.86 
 
 		 388 aa  269  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  38.82 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  38.89 
 
 		 492 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  41.11 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  38.36 
 
 		 492 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  40.59 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  35.81 
 
 		 485 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  38.18 
 
 		 492 aa  261  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  40.16 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  38.36 
 
 		 492 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  39.04 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  39.33 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  37.83 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  41.35 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  37.3 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  43.79 
 
 		 377 aa  256  8e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.67 
 
 		 381 aa  256  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  41.03 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  39.19 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  39.26 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  40.51 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  36.49 
 
 		 508 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  38.71 
 
 		 376 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36.98 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.63 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.94 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  33.33 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  36.6 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  39.47 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  39.79 
 
 		 522 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  38.64 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  37.9 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  38.86 
 
 		 460 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  35.12 
 
 		 539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  35.12 
 
 		 539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  38.99 
 
 		 390 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  37.03 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  33.71 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 521 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  36.07 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  38.74 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  35.14 
 
 		 511 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  38.93 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  38.38 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  34.71 
 
 		 536 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  37.76 
 
 		 546 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  33.68 
 
 		 546 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  38.77 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  36.87 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  37.43 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  36.63 
 
 		 513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  35.61 
 
 		 536 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  35.61 
 
 		 536 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  34.41 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  37.76 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  35.82 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  34.31 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  36.34 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  35.9 
 
 		 536 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  37.8 
 
 		 518 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  36.67 
 
 		 525 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  38.26 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  38.44 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  37.77 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  36.21 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  34.19 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  37.17 
 
 		 393 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  41 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  36.61 
 
 		 372 aa  230  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  37.17 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  37.43 
 
 		 384 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  35.87 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  39.95 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  34.54 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  34.4 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  38.13 
 
 		 377 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  34.18 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  34.69 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  36.32 
 
 		 528 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  33.93 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  36.93 
 
 		 491 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  37.46 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>