More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3466 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 389 aa  791    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  77.6 
 
 		 383 aa  594  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  73.66 
 
 		 383 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  73.91 
 
 		 380 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  73.39 
 
 		 383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  66.22 
 
 		 382 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  66.13 
 
 		 382 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  67.21 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  56.56 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  54.62 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  53.33 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  50.14 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  53.13 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  49.6 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  52.17 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  50.27 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  53.42 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  50.68 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  50.68 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  54.35 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  51.89 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  52.46 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  52.6 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  52.19 
 
 		 377 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  48.66 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  50.82 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  52.19 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  50.55 
 
 		 377 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  49.32 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  49.87 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  49.86 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  49.86 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  48.63 
 
 		 384 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  51.24 
 
 		 395 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  47.01 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  50.99 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  49.05 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  48.91 
 
 		 384 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  48.9 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  46.78 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  45.38 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  48.92 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  44.02 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  45.23 
 
 		 400 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  44.23 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  46.03 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  43.29 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  42.15 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  43.75 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  42.59 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  41.86 
 
 		 492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  41.57 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  43.65 
 
 		 503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.57 
 
 		 500 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  41.57 
 
 		 492 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  42.08 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  43.29 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  41.41 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  39.94 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  40.29 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  40.06 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  48.7 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  40.93 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  43.68 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  45.81 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.36 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.34 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  42.03 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  39.36 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  39.39 
 
 		 514 aa  267  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  39.84 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.07 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  47.22 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2269  homocitrate synthase  47.62 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.613685  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3580  homocitrate synthase  45.78 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483441  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  47.27 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  40.75 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  40.28 
 
 		 508 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.48 
 
 		 505 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  37.91 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  37.96 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  40.92 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  41.59 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  38.69 
 
 		 406 aa  256  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  40.28 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.53 
 
 		 504 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  37.33 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  37.68 
 
 		 514 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  37.39 
 
 		 514 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  40.71 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  37.39 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  43.02 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  40 
 
 		 376 aa  249  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.71 
 
 		 496 aa  249  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  47.51 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  39.44 
 
 		 511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  38.61 
 
 		 509 aa  245  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0409  pyruvate carboxyltransferase  48.98 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000285195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>