More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2032 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 390 aa  798    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  57.03 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  50.13 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  48.01 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  49.33 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  49.06 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  46.06 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  47.44 
 
 		 513 aa  355  5e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  47.18 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  46.58 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  46.01 
 
 		 524 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  48.12 
 
 		 532 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  47.07 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  49.33 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  47.61 
 
 		 523 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  45.19 
 
 		 525 aa  345  8e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  45.48 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  45.48 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  46.54 
 
 		 527 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  44.68 
 
 		 519 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  44.68 
 
 		 519 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  47.77 
 
 		 524 aa  339  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  47.75 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 		 518 aa  336  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  46.11 
 
 		 527 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 505 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  45.05 
 
 		 507 aa  332  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  45 
 
 		 514 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  47.11 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  46.68 
 
 		 529 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  46.68 
 
 		 529 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  46.42 
 
 		 529 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  45.38 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  45.38 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  45.38 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  45.07 
 
 		 526 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  45.79 
 
 		 521 aa  329  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  46.54 
 
 		 503 aa  328  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  44.76 
 
 		 536 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  43.77 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  43.88 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  46.3 
 
 		 519 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  43.88 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  46.28 
 
 		 525 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  44.06 
 
 		 508 aa  326  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  44.97 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  46.92 
 
 		 536 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  45.41 
 
 		 512 aa  326  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  44.88 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  45.9 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  45.5 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  43.88 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  46.26 
 
 		 516 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  43.77 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  45.24 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  44.53 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  45.21 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  44.88 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 		 519 aa  322  6e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  45.77 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  45.24 
 
 		 520 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  45.09 
 
 		 512 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  43.35 
 
 		 511 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  44.85 
 
 		 509 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  44.33 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  46.03 
 
 		 520 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  44.07 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  44.16 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  44.07 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  42.86 
 
 		 528 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  42.56 
 
 		 514 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  44.19 
 
 		 520 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  44.19 
 
 		 520 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  44.62 
 
 		 546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  43.35 
 
 		 523 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  44.76 
 
 		 520 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  43.62 
 
 		 523 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  44.62 
 
 		 546 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  44.5 
 
 		 393 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  43.42 
 
 		 515 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  44.62 
 
 		 546 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>