More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0388 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  58.17 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3547  tRNA pseudouridine synthase B  56.16 
 
 		 228 aa  241  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1673  tRNA pseudouridine synthase B  52.34 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0789  tRNA pseudouridine synthase B  52.88 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  51.14 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0570  tRNA pseudouridine synthase B  51.4 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  51.21 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1973  tRNA pseudouridine synthase B  50.48 
 
 		 558 aa  212  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0369  tRNA pseudouridine synthase B  47.91 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0446306  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1460  tRNA pseudouridine synthase B  46.95 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000738183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0302  tRNA pseudouridine synthase B  46.33 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000137862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0400  tRNA pseudouridine synthase B  45.79 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  42.45 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0371  tRNA pseudouridine synthase B  43.1 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  43.32 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  42.52 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 306 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1777  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 289 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123602  normal  0.16523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0404  tRNA pseudouridine synthase B  43.6 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00439158  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 		 304 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.26 
 
 		 303 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  42.03 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 295 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  37.67 
 
 		 310 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  41.43 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 		 305 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  38.97 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 304 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  43.06 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 299 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  35.32 
 
 		 289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  43.6 
 
 		 308 aa  164  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  42.58 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 327 aa  161  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  36.49 
 
 		 304 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 300 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  40.87 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  36.62 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 298 aa  158  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  39.61 
 
 		 300 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2418  tRNA pseudouridine synthase B  37.39 
 
 		 307 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0980712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  37.28 
 
 		 330 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  42.03 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  38.74 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  36.99 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 294 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  35.78 
 
 		 307 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3165  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 		 309 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.498601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  38.14 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.04 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.72 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  43.52 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  38.53 
 
 		 305 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  36.74 
 
 		 380 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  38.18 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2510  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  36.2 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 311 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  39.34 
 
 		 300 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  36.28 
 
 		 359 aa  151  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  41.35 
 
 		 295 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 		 305 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  38.32 
 
 		 327 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  38.12 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 		 301 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  35.65 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  36.53 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 309 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  38.67 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  35.32 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  37.67 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  34.35 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>