More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0908 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  37.88 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 291 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  39.64 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  41.96 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  41.11 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  34.68 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  43.45 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  39.24 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  34.01 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  36.77 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  34.46 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  42.69 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  37.42 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  35.93 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  35.93 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  35.37 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3724  tRNA pseudouridine synthase B  36.46 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  33.89 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  35.05 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  36.63 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  34.78 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  37.24 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  35.93 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.31 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  35.25 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 351 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  34.24 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  35.96 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  39.73 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  36.43 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.56 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  36.43 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.56 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  37.31 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  37.58 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 341 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  39.7 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  35.25 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  34.46 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 358 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  36.73 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  36.65 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  37.84 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  37.33 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  36.4 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  33.78 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  37.93 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  37.33 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  38.74 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>