More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1288 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  93.51 
 
 		 308 aa  587  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  56.33 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  54.36 
 
 		 301 aa  336  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  55.59 
 
 		 293 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  54.42 
 
 		 291 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  50.98 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  49.32 
 
 		 294 aa  272  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  43.49 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  43.03 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  42.54 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.07 
 
 		 307 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  39.03 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.53 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.06 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.17 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.87 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.33 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  39.01 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  42.65 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  38.46 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  38.3 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  39.87 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  35.82 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  39.73 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  39.79 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  36.17 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  49.07 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.6 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  41.73 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.04 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  41.22 
 
 		 304 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  38.25 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  40.56 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  36.75 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  36.75 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 344 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  44.98 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  36.84 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 339 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 330 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  35.05 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  36.91 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.11 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  45.64 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  38.25 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  37.23 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  35.23 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.25 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  37.08 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  36.86 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  40.48 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>