More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1158 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  77.48 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  61.13 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  60.13 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  59.8 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  59.8 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  59.47 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  59.47 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  59.47 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  59.47 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  59.14 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  59.47 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  58.8 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  44.85 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  47.88 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  47.67 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  46.59 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  43.25 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  46.09 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  46.21 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  46.21 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  39.87 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  47.95 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  44.02 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  40.59 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  47.13 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  40.45 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.36 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  43.77 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  45.21 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  44.92 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  46.47 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  46.07 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.78 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  45.59 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  44 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  36.66 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  43.94 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  45.21 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  44.09 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  46.93 
 
 		 321 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  43.24 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  38.95 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  42.97 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1232  tRNA pseudouridine synthase B  40.13 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  42.53 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  45.08 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  43.24 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.24 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  44.67 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  41.9 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  41.9 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  44.87 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  41.13 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  39.67 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  39.77 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3381  tRNA pseudouridine synthase B  45.61 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.092575  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  41.51 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  43.36 
 
 		 339 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  39.78 
 
 		 307 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  42.29 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  40.23 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  42.69 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  39.77 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  42.75 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  41.09 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  39.25 
 
 		 324 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>