More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1336 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 305 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  92.74 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  63.55 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  57.53 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  58.11 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  56.15 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  58.97 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  56.9 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  56.16 
 
 		 293 aa  291  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  59.27 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  57.49 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  57.49 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  57.49 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  53.4 
 
 		 299 aa  285  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  55.2 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  55.9 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  57.93 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  58.02 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  56.9 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  53.79 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  56.01 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  55.33 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  54.14 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  57.53 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  55.63 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  54.92 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  55.12 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  54.46 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  55.86 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  57.14 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  52.72 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  50.34 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  53.58 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  49.67 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.78 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  50.17 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  48.05 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  43.58 
 
 		 291 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  46.54 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.53 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  45.91 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  46.76 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.6 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  46.43 
 
 		 387 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  51.38 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  49.1 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.71 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  46.85 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.27 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  44.39 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  49.07 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  42.68 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  40.18 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  44 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  46.73 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  47.69 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  43.27 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  43.21 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  40.71 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  37.24 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.56 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  44.19 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  44.31 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  40.6 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  48.13 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  48.13 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  43.53 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  43.23 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  44 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  47 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  34.97 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  47.44 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  47.66 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  42.9 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  42.11 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  39.32 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  41.8 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  42.58 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  45.33 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  42.47 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  44.24 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  44.64 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  47.66 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>