More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1222 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 294 aa  587  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  54.26 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  52.4 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  50.67 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  49.32 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  48.65 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  50.84 
 
 		 299 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  49.83 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  49.49 
 
 		 315 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  48.53 
 
 		 323 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  42.58 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  48.47 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.55 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  36.48 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  39.55 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  36.6 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.29 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.92 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  40.94 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  43.68 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  43.7 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  49.56 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.42 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  43.82 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  48.13 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  42.35 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  48.84 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  36.72 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  44.66 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.02 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.72 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  46.4 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  42.43 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  39.74 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  44.17 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  36.62 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  45.16 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  41.96 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  41.26 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  37.06 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  41.78 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  42.46 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  38.72 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  41.61 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  37.75 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  41.11 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  37.33 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  38.79 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  44.24 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  40.84 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  46.01 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  49.3 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  37.26 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  34.52 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  41.47 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  37.18 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  38.57 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  43.81 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  41.96 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  38.13 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  45.24 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  38.78 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  41.61 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  40.64 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  39.86 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>