More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15331 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  89.25 
 
 		 307 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  86.32 
 
 		 307 aa  547  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  72.13 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  46.28 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  39.56 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  46.69 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  46.69 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.47 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  40.59 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  35.67 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  37.66 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  36.48 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  40.7 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  36.71 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 293 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  36.8 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  36.4 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  33.56 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  35.16 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  36.09 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  39.07 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  37.75 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  38.43 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  39.33 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 		 354 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  37.39 
 
 		 295 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.1 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  40.65 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  37.82 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  33.71 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  31.52 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  30.62 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  33.73 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  38.43 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  39.32 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  31.09 
 
 		 315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  36.51 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  31.6 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  38.16 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.33 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  37.13 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  31.7 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  32.7 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  31.37 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  34.68 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  35.78 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  34.11 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  30.56 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  34.11 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  32.83 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  31.23 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>