More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1331 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 305 aa  620  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  71.8 
 
 		 305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  47.85 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  45.72 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  44.04 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  44.7 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  44.7 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  46.76 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  41.94 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  42.35 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  45.9 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  41.37 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  45.74 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  42.31 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  38.61 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  36.93 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  37.58 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  35.62 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  36.1 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  35.95 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  36.93 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  35.95 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.38 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  39.85 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  42.4 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  39.85 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  37.15 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  38.81 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  36.75 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  38.67 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  39 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  38.35 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  37.84 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  36.3 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  38.2 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  38.2 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.09 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  35.74 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  37.64 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  39.43 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3381  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.092575  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  38.35 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  37.98 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  37.84 
 
 		 291 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  38.34 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  35.85 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>