More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14011 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  100 
 
 		 309 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  49.06 
 
 		 323 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  53.04 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  53.04 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  48.21 
 
 		 315 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  47.88 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  46.28 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  45.98 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  46.28 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  50.19 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  44.88 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  42.54 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  42.58 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  44.53 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  44.91 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  46.76 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  40.57 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  41.02 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.19 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  42.02 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  32.47 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  32.47 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  47.69 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  43.52 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  39.04 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  42.38 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  41.71 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  35.67 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  40.24 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  42.99 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  31.7 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  48.21 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.58 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  44.34 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  48.57 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  45.02 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  43.87 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  42.65 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.84 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  38.03 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  38.84 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  40.96 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  41.43 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  39.21 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  37.45 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  36.6 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  36.3 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  40.99 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  39.82 
 
 		 241 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  40.51 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  36.47 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  37.61 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  43.96 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  40.99 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 310 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 		 371 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  31.72 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  38.79 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  37.13 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  39.11 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  37.75 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  43.84 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  41.29 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  42.18 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  38.53 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  34.97 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  44.06 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  35.2 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  36.08 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  39.11 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  40.76 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  33.11 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2813  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>