More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1438 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  50.23 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  50.94 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  49.53 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  51.14 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  49.07 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  48.58 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  50.47 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  45.79 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  49 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  50.69 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  51.42 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  48.17 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  49.75 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  46.73 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  39.37 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  37.54 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 291 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  47.3 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  50.24 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  40.15 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  39.69 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  48.62 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  51.44 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  48.85 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  48.39 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  43.02 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  45.02 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  50.48 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  50.23 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  39.56 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.61 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  35.03 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  42.01 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  41.33 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  34.58 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  44.39 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.02 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  42.66 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.67 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  33.75 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  46.36 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0789  tRNA pseudouridine synthase B  43.38 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  45.34 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  33.75 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  50.7 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  42.2 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  46.33 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  41.94 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.43 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  38.35 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  46.83 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  46.83 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  46.83 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  33.88 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  41.35 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  42.29 
 
 		 371 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  48.58 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  34.63 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  40.21 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  40.46 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  41.63 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  42.65 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  42.98 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  31.35 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  31.41 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  38.66 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  40.64 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>