More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2095 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  76.82 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  73.7 
 
 		 294 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  70.07 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  58.76 
 
 		 299 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  59.86 
 
 		 297 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  58.19 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  57.63 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  57.64 
 
 		 293 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  55.48 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  56.14 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  57.84 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  55.18 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  58.25 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  56.21 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  55.29 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  54.67 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  56.75 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  56.6 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  57.19 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  53.98 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  53.4 
 
 		 307 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  55.93 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  54.23 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  55.52 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  54.15 
 
 		 325 aa  254  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  51.6 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  54.83 
 
 		 327 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  53.94 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  48.94 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  58.45 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  49.16 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  44.11 
 
 		 348 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  51.67 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  47.59 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  47.81 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  49.4 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  45.68 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.14 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  47.06 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.47 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  49.53 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  50.47 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  42.02 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  45.65 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  45.8 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  43.25 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  44.19 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  45.12 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  43.97 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.66 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  44.32 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  43.98 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.68 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  46.19 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  43.25 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  47.47 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  45.07 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  41.99 
 
 		 363 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  46.73 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  41.52 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  39 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  41.26 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  46.73 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.53 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  40.31 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  40.7 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  40.31 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.04 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  40.31 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  40.31 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  42.05 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  44.72 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>