More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1000 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  68.21 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  50.96 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  52.61 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  52.61 
 
 		 307 aa  275  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  52.96 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  52.61 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  52.61 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  52.78 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  51.92 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  51.57 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  52.26 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  52.08 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  50.17 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  48.81 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  46.76 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  46.76 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  45.99 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  43.25 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  47.41 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 		 297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  40.35 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  39.65 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  39.65 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  39.65 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  41.2 
 
 		 302 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  45.34 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  43.32 
 
 		 311 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  43.32 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  38.95 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  43.85 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  41.7 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  40.28 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  41.27 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  39.19 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  38.85 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  45.41 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  40.24 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  36.64 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  40.56 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  41.37 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.9 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  39.55 
 
 		 307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  40.24 
 
 		 311 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  40.65 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  40.33 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  37.63 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  39.85 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  43.51 
 
 		 306 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  39.1 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  38.22 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  39.76 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  39 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  42.26 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  37.36 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  42.37 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  41.84 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  37.81 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  41.42 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  37.4 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  35.59 
 
 		 291 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  37.06 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  38.35 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  37.82 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  41.06 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  41.15 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  34.52 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  41.1 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1919  pseudouridylate synthase  42.11 
 
 		 345 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0760202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>