More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15481 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  89.25 
 
 		 305 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  83.06 
 
 		 307 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  72.31 
 
 		 305 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  45.98 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  39.94 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  45.43 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  45.11 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.39 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  39.07 
 
 		 308 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  36.09 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  35.92 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  36.43 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  39.81 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  39.72 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.58 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  35.14 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  34.84 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  39.33 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  32.87 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  36.78 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  36.59 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  34.63 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  32.9 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  39.67 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.82 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.45 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.82 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  38.6 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  30.95 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  36.1 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  34.16 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  37.6 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  36.74 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 		 283 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  32.9 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  31.23 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  36.74 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  32.9 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  31.48 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  35.52 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  33.99 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  39.09 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  30.55 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  31.92 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  36.44 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  33.06 
 
 		 354 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  39.3 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  35.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  34.56 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  30.69 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  35.98 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  40.19 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  30.39 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  37.86 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  34.5 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  34.2 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  35.48 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  30.07 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  29.48 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  34.78 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  33.06 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  30.07 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  29.66 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  33.07 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  28.71 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  29.74 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>