More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1105 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 313 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  94.89 
 
 		 313 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  94.25 
 
 		 313 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  64.06 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  44.64 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  45.15 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  43.31 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  42.96 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  42.25 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  40.71 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  44.11 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  39.79 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  42.31 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.73 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  39.08 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  41.9 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  42.9 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  48.62 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  43.1 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  46.69 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  43.05 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  43.63 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  38.41 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  50.69 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.85 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  40.73 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.25 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  43.88 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.92 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.25 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  44.52 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.25 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  40.69 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  37.15 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  37.15 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  45.63 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  36.23 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  45.63 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  45.63 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  40.15 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.07 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  37.55 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  43.14 
 
 		 412 aa  185  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  40.39 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  43.92 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  46.01 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  43.96 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  44.87 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  40.45 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  45.78 
 
 		 327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  44.87 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  36.81 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  43.09 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  41.41 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  41.08 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  40.95 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  42.44 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  41.18 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  36.98 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>