More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1233 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  98.08 
 
 		 313 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  94.25 
 
 		 313 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  65 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  43.31 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  42.96 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  44.48 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  40.85 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  44.73 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  44.78 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  39.79 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  39.1 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  38.73 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  41.92 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  40.14 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 314 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  48.22 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  46.44 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  43.63 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  38.02 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  45.15 
 
 		 241 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  41.39 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.87 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.81 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  42.76 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  41.09 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  39.54 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.13 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  35.6 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  38.64 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  37.55 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.85 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  44.37 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  40.65 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  48.85 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  39.62 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  35.76 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  35.99 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  39.67 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  36.23 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  43.85 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  41.7 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  44.11 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  39.81 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  44.49 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  42.53 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  41.41 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  36.96 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  36.66 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  39.8 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  43.71 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  39.66 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  39.66 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  43.73 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  44.11 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  40.23 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 366 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>