More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2329 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 302 aa  591  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  84.48 
 
 		 294 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  77.11 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  77.11 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  77.11 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  73.79 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  64.81 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  60.9 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  59.12 
 
 		 299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  62.37 
 
 		 295 aa  335  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  56.86 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  54.98 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  54.55 
 
 		 322 aa  298  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  59.3 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  57.29 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  54.95 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  58.8 
 
 		 289 aa  285  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  55.52 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  58.82 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  54.03 
 
 		 301 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  56.34 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  56.25 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  57.53 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  53.24 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  58.97 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  57.71 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  55.15 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  57.19 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  50.52 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  52.29 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  49.36 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  50.5 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  51.09 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  52.16 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  49.65 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  44.48 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  46.37 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  45.24 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  48.09 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.54 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  49.3 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.3 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  46.96 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  43.49 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  43.49 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  44.81 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  49.55 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  38.81 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  37.41 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  50.94 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  44.65 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  44.28 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  44.06 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.55 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.92 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  47.51 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  45.78 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  41.41 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  40.75 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  45.66 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  41.64 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  43.56 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 307 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  41.04 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  48.13 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  45.22 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  48.13 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  39.53 
 
 		 307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  43.82 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  39.19 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  42.63 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  46.05 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 241 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  46.05 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  44.7 
 
 		 244 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  46.23 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  44.89 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  45.62 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>