More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3327 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  74.39 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  74.74 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  68.6 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  60.4 
 
 		 306 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  64.71 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  59.46 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  65.38 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  60.14 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  59.23 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  59.3 
 
 		 302 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  59.65 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  59.65 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  62.33 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  59.3 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  60.27 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  57.86 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  57.86 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  57.86 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  58.04 
 
 		 298 aa  291  6e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  55.56 
 
 		 298 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  55.24 
 
 		 299 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  58.02 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  57.89 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  58.36 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  54.36 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  53.55 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  53.95 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  57.93 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  53.92 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  57.09 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  52.16 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  52.36 
 
 		 303 aa  251  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  55.22 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  48.32 
 
 		 333 aa  228  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  44.04 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  50.64 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  45.33 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  46.96 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  48.39 
 
 		 387 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  42.07 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  45.63 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  46.13 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  41.38 
 
 		 291 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  48.88 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  50.24 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  44.33 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  50 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  45.7 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  51.39 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  42.35 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  44.32 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  42.72 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  43.09 
 
 		 313 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  41.84 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  47.96 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  47.42 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  42.71 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  47.89 
 
 		 244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  42.03 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  48.15 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  48.21 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  43.89 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  45.14 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  34.59 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  44.09 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  41.7 
 
 		 344 aa  188  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  42.7 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  43.89 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  49.52 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  41.39 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.72 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  41.41 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  48.87 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.22 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  43.31 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  47.31 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  41.1 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  41.47 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  43.7 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  41.39 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  45.3 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  38.55 
 
 		 330 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>