More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12806 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 298 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  73.79 
 
 		 302 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  71.13 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  71.13 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  71.13 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  69.49 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  58.13 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  55.44 
 
 		 299 aa  321  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  54.64 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  56.01 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  52.98 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  52.15 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  55.56 
 
 		 289 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  53.66 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  51.84 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  50.69 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  53.33 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  51.9 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  49.49 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  53.12 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  51.37 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  53.28 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  53.79 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  51.03 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  51.19 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  52.41 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  50.51 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  48.84 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  48.68 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  42.99 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  45.67 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  49.67 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  45.58 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  45.99 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  46.27 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  46.98 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  44.53 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  47.17 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  48.58 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  46.67 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  45.06 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  43.56 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  42.16 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  44.65 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  43.07 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  45.82 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.48 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  45.37 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  43.24 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  42.98 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  43.82 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  44.34 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  45.07 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  38.34 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  40.14 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  39.52 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  40.27 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  40.67 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  43.24 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  43.29 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  43.46 
 
 		 314 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  36.46 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.87 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  42.56 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  43.11 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  41.87 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  40.64 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  40.48 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  46.3 
 
 		 363 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  44.86 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  43.54 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>