More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0543 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  70 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  55.9 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  47.88 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  45.22 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.97 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  41.91 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.59 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.93 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  40.06 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  48.47 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  41.69 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  41.12 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  44.31 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  38.59 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  45.35 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  40.51 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  45.06 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  42.75 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  41.87 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  41.87 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  41.87 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  39.09 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  42.64 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  42.96 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  38.72 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  38.59 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  43.36 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  41.12 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  41.27 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  39.52 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  36.16 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  36.16 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  40.98 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  37.92 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  36.91 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  41.63 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  35.76 
 
 		 324 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  38.26 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  36.31 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  40.22 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  40 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  37.75 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  50.69 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  43.27 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  40.17 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  43.96 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  41.07 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  39.76 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  39.76 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  43.2 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  32.87 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  40.44 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  38.2 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  37.09 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  35.66 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  37.35 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  43.94 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 371 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  37.16 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  42.73 
 
 		 348 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  36.7 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>