More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5113 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  58.67 
 
 		 308 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  56.33 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  54.49 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  52.96 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  52.79 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  54.26 
 
 		 294 aa  278  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.53 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.12 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  39.47 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.46 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  42.69 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.91 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.66 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.14 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  44.75 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  43.73 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.34 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 		 336 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  42.35 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  42.47 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  40.94 
 
 		 330 aa  191  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  44.31 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  36.99 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  46.01 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  47.91 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  42.75 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  45.54 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.2 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.19 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.76 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.57 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  37.89 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  44.8 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  36.01 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  36.92 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  43.7 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  38.52 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  42.58 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  41.87 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  37.63 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  38.69 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.88 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  39.1 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  37.78 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  39.29 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  39.29 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  42.92 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  37.11 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  33.01 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 304 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  42.21 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  39.71 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 283 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  44.35 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  39.16 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  36.43 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  38.82 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  43.78 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  38.36 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 		 371 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  39.34 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  38.38 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>