More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1256 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 320 aa  668    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  64.29 
 
 		 324 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  64.29 
 
 		 324 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  63.16 
 
 		 324 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  56.78 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  60.06 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  57.23 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  56.29 
 
 		 310 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  55.97 
 
 		 310 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  51.27 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  50.79 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  51.27 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  50.96 
 
 		 387 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  50.16 
 
 		 412 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  49.84 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  47.12 
 
 		 354 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  46.79 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  45.31 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  45.94 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  44.73 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  45.08 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  43.95 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  43.95 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  41.51 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 304 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  42.63 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  42.04 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  47.62 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  40.26 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  40.84 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 308 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  41.4 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  41.53 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2801  tRNA pseudouridine synthase B  41.08 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  42.77 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  39.1 
 
 		 301 aa  215  9e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  37.97 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  34.7 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3724  tRNA pseudouridine synthase B  40.72 
 
 		 319 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  33.33 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  34.59 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  34.07 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  41.04 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1697  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2484  tRNA pseudouridine synthase B  38.41 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  34.18 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  33.55 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  33.55 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  35.05 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  35.2 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000961174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  35.33 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  43.5 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  33.23 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  36.62 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  38.95 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  36.86 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.11 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  37.68 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  43.18 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  34.86 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  34.08 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  41.1 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  41.1 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  32.48 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  31.03 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  36.33 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  34.8 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  33.94 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  42.27 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>