More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1745 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  100 
 
 		 387 aa  781    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  44.08 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  49 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  41.81 
 
 		 306 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  38.92 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  41.93 
 
 		 343 aa  209  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  39.12 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  39.11 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  48.39 
 
 		 289 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  47.98 
 
 		 297 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  48.81 
 
 		 293 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  48.8 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  49.41 
 
 		 318 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  47.18 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  46.59 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  46.96 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  49.59 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  49.59 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 289 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  49.59 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  45.06 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  48.19 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  44.76 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  47.76 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  37.82 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  46.18 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  44.98 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  44.94 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  44.94 
 
 		 294 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.66 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  47.39 
 
 		 305 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  43.65 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 291 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  45.63 
 
 		 305 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  43.37 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  45.77 
 
 		 323 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  40.78 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  46.03 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  40.65 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  42.51 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  42.17 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  39.11 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  44.36 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  38.17 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  36.55 
 
 		 303 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 313 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  40.87 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.06 
 
 		 314 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 302 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  40.49 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  39.39 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  38.34 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 314 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  39.76 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  39.02 
 
 		 300 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  39.68 
 
 		 318 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  37.25 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  34.87 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  39.18 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  37.2 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 311 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  39.68 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  38.71 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  34.67 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  39.27 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  41.84 
 
 		 309 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  39.84 
 
 		 341 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 		 304 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 311 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 		 335 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>