More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32966 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_32966  predicted protein  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  46.22 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1673  tRNA pseudouridine synthase B  44.24 
 
 		 232 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  48.66 
 
 		 249 aa  195  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0570  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 229 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  48.86 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  47.25 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  45.62 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  48.15 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  46.51 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  45.37 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1973  tRNA pseudouridine synthase B  46.23 
 
 		 558 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  48.36 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  49.54 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.87 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 344 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0071  tRNA pseudouridine synthase B  45.58 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1246  tRNA pseudouridine synthase B  44.29 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0789  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0369  tRNA pseudouridine synthase B  45.21 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0446306  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0388  hypothetical protein  42.52 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0400  tRNA pseudouridine synthase B  49 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0404  tRNA pseudouridine synthase B  46.92 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00439158  normal  0.254846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  47.95 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  45.62 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0302  tRNA pseudouridine synthase B  48.26 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000137862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  47.14 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1460  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000738183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  47.42 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0749  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.844641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3547  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 		 228 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1777  tRNA pseudouridine synthase B  45.75 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123602  normal  0.16523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  45 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  43.81 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  45.87 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  44.95 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  46.3 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  40.99 
 
 		 306 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  41.74 
 
 		 302 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  43.64 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  41.03 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  39.73 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  44.6 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  43.17 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  44.6 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  44.6 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  41.84 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  43.64 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  45.21 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  45.12 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  43.66 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  46.08 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  40.95 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  46.08 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  40.74 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  43.42 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  45.5 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  43.52 
 
 		 307 aa  161  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  43.06 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  43.69 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  42.92 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  45.62 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  42.67 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  45.05 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  44.19 
 
 		 338 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  42.01 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  43.19 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  44.29 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  42.66 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1415  tRNA pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334463  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  45.16 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  40.89 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  41.89 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  45.83 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0676  tRNA pseudouridine synthase B  41.31 
 
 		 235 aa  156  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000650493 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  42.49 
 
 		 330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  41.63 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  43.95 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  41.89 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  44.7 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  42.72 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  44.29 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  44.55 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  44.98 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  40.28 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>