175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1913 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  53.11 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  35.5 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  47.71 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  33.47 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  31.62 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 195 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  28.92 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  27.16 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.31 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  27.95 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  23 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  32.73 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 400 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  24.37 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>