136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2612 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 462 aa  904    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  58.58 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  32.89 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  33.06 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.37 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  31.95 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.51 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  29.49 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  29.92 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  27.23 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  30.97 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  31.93 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  27.85 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  27.14 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  37.72 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.46 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.46 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.46 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.04 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  38.68 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 516 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.18 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  26.76 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.71 
 
 		 459 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  36.26 
 
 		 520 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.04 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.56 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  34.88 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  44.07 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  27.62 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  25.31 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35.29 
 
 		 525 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  20.38 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  29.97 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33.85 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  36.79 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 553 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.89 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  32.93 
 
 		 495 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  46.55 
 
 		 517 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  25.88 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  40.79 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  42.19 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.94 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.4 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.06 
 
 		 558 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  33.75 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  32.61 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  40.62 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  33.9 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  38.67 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  39.24 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  38.37 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 416 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  38.37 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  38.37 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  34.74 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.49 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  36.84 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  36.84 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  36.84 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  32.31 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  32.99 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.23 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  43.48 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26290  sugar diacid utilization regulator  37.5 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.687043  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  31.69 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>