More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1337 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  100 
 
 		 1434 aa  2664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.69 
 
 		 11716 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  65.01 
 
 		 702 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.98 
 
 		 2064 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  59.8 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  56 
 
 		 621 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  43.94 
 
 		 706 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  49.71 
 
 		 1827 aa  317  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  34.63 
 
 		 811 aa  246  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.01 
 
 		 2507 aa  238  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  36.63 
 
 		 819 aa  237  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  41.15 
 
 		 937 aa  203  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  36.82 
 
 		 503 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  31.5 
 
 		 1433 aa  195  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.54 
 
 		 1437 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  37.37 
 
 		 1348 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  36.87 
 
 		 1337 aa  173  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.17 
 
 		 1073 aa  172  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  32.78 
 
 		 1346 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  37.2 
 
 		 885 aa  152  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  36.72 
 
 		 935 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  29.52 
 
 		 752 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  45.45 
 
 		 3209 aa  96.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 		 749 aa  95.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.51 
 
 		 466 aa  95.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  44.96 
 
 		 912 aa  85.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 		 1073 aa  85.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.12 
 
 		 9867 aa  82.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  57.89 
 
 		 4285 aa  82.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  43.1 
 
 		 2743 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.76 
 
 		 2239 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  49.38 
 
 		 4848 aa  76.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  51.76 
 
 		 6779 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  51.76 
 
 		 6662 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.76 
 
 		 6683 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  28.28 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  34.48 
 
 		 417 aa  74.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.13 
 
 		 5839 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.24 
 
 		 2812 aa  72  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  39.09 
 
 		 2890 aa  71.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.63 
 
 		 4220 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.41 
 
 		 1883 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  52.56 
 
 		 5218 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  53.42 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  53.95 
 
 		 16322 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 5787 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.81 
 
 		 1839 aa  69.3  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 1148 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 1148 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  47.42 
 
 		 8682 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.32 
 
 		 1424 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  48.42 
 
 		 2542 aa  67.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  53.33 
 
 		 4214 aa  67  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 3184 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  44.44 
 
 		 2701 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  47.42 
 
 		 9030 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  51.25 
 
 		 4678 aa  66.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.02 
 
 		 5962 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  33.33 
 
 		 2251 aa  65.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  50.68 
 
 		 5444 aa  65.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  46.07 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  42.71 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  46.39 
 
 		 6753 aa  65.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  44.66 
 
 		 5442 aa  65.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  46.15 
 
 		 1202 aa  65.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  44.09 
 
 		 1610 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  44.09 
 
 		 1610 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  36.76 
 
 		 2198 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 677 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  42.39 
 
 		 833 aa  64.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.55 
 
 		 1403 aa  64.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 491 aa  64.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  28.37 
 
 		 500 aa  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.76 
 
 		 2133 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  41.18 
 
 		 8321 aa  63.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  43.22 
 
 		 2555 aa  63.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  45.26 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.66 
 
 		 998 aa  62.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.84 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  47.78 
 
 		 856 aa  62.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  51.95 
 
 		 2768 aa  62.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  41.75 
 
 		 6678 aa  62.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  48.24 
 
 		 5171 aa  62.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1076 aa  62  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  45.45 
 
 		 2924 aa  62.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  41.57 
 
 		 745 aa  62  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  45.71 
 
 		 535 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.87 
 
 		 1699 aa  61.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 		 1166 aa  61.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.89 
 
 		 4836 aa  61.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 393 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.35 
 
 		 2954 aa  61.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  39 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 387 aa  60.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>