More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1300 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.17 
 
 		 1169 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  38.52 
 
 		 1199 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1183 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.58 
 
 		 1148 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  40.02 
 
 		 1157 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.13 
 
 		 1155 aa  640    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.17 
 
 		 1169 aa  681    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  57.3 
 
 		 1158 aa  1375    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  75.92 
 
 		 1193 aa  1821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1176 aa  733    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.47 
 
 		 1178 aa  735    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1176 aa  735    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  38.37 
 
 		 1188 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  40.23 
 
 		 1123 aa  719    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1177 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  56.49 
 
 		 1169 aa  1450    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  60.93 
 
 		 1167 aa  1527    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  47.06 
 
 		 1170 aa  1203    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  61.54 
 
 		 1169 aa  1477    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1168 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  58.55 
 
 		 1188 aa  1408    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1170 aa  720    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1178 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  36.14 
 
 		 1207 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.3 
 
 		 1154 aa  675    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1157 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1168 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  86.66 
 
 		 1192 aa  2126    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1192 aa  2420    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1158 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.45 
 
 		 1176 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  39.14 
 
 		 1182 aa  690    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1176 aa  733    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  46.21 
 
 		 1174 aa  1199    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  61.45 
 
 		 1153 aa  1428    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  57.09 
 
 		 1158 aa  1372    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1183 aa  715    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  61.35 
 
 		 1167 aa  1534    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1208 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  58.14 
 
 		 1166 aa  1374    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.48 
 
 		 1176 aa  750    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1179 aa  667    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1150 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  38.81 
 
 		 1218 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1176 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.47 
 
 		 1176 aa  734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  36.07 
 
 		 1157 aa  662    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  47.63 
 
 		 1175 aa  1208    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1182 aa  667    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1165 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  38.68 
 
 		 1168 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  34.78 
 
 		 1147 aa  640    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1176 aa  732    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.2 
 
 		 1246 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1148 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  35.16 
 
 		 1179 aa  689    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1165 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 		 1162 aa  712    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  35.43 
 
 		 1162 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  36.49 
 
 		 1197 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  53.39 
 
 		 1180 aa  1292    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1155 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.21 
 
 		 1174 aa  690    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  34.64 
 
 		 1073 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1141 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  57.93 
 
 		 1168 aa  1394    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  35.58 
 
 		 1162 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 		 1159 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.64 
 
 		 1165 aa  685    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  33.94 
 
 		 1179 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1168 aa  675    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  37.03 
 
 		 1222 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  35.58 
 
 		 1196 aa  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1189 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.58 
 
 		 1177 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.99 
 
 		 1176 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  46.77 
 
 		 1169 aa  1196    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  39.52 
 
 		 1164 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  38.43 
 
 		 1212 aa  643    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1193 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  38.02 
 
 		 1210 aa  635  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  44.73 
 
 		 1197 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  35.57 
 
 		 1162 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  38.12 
 
 		 1155 aa  635  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1212 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  36.91 
 
 		 1216 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  36.93 
 
 		 1157 aa  632  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  37.58 
 
 		 1157 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  44.24 
 
 		 1176 aa  632  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  37.22 
 
 		 1182 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  35.73 
 
 		 1160 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  33.65 
 
 		 1113 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1160 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  38.69 
 
 		 1192 aa  632  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  36.71 
 
 		 1157 aa  632  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  44.24 
 
 		 1176 aa  632  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1164 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1162 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  32.91 
 
 		 1122 aa  626  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1160 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>