More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  63.68 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  54.12 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  60 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  51.32 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  38.12 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.52 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  35.87 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  33.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  30.36 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.6 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.7 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>