More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7540 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 216 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  52.84 
 
 		 319 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  48.55 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  31.87 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.06 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.52 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.06 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  39 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  45.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  45.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  45.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  39 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  23.17 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 333 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 307 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>