More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2686 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  69.66 
 
 		 186 aa  270  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  70.22 
 
 		 187 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 428 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 415 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 244 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  25.99 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  27.56 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  26.62 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3475  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 245 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 357 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  33.8 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.93 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>