More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0530 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  909    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  74.89 
 
 		 462 aa  677    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.13 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  46.54 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  48.1 
 
 		 1029 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.1 
 
 		 1029 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  47.79 
 
 		 1112 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  38.31 
 
 		 614 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 		 546 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  49.55 
 
 		 1112 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 286 aa  93.2  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  26.32 
 
 		 302 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 		 2346 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  49.61 
 
 		 531 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  43.06 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  38.61 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.3 
 
 		 1180 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  28.17 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 1072 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  27.21 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  41.33 
 
 		 2567 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.97 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  49.61 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.18 
 
 		 1019 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 917 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.26 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  38.32 
 
 		 1055 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.21 
 
 		 1415 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 1022 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 1017 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  44.35 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  53.85 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  40.13 
 
 		 1175 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  39.74 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.71 
 
 		 2678 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.78 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  38.57 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  56.52 
 
 		 1883 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 652 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 		 1610 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  50 
 
 		 1164 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  54.22 
 
 		 1202 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  51.85 
 
 		 1699 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.25 
 
 		 6683 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  51.25 
 
 		 6662 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.85 
 
 		 2239 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  51.25 
 
 		 6779 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.1 
 
 		 1079 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  41.32 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.35 
 
 		 1839 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  42.59 
 
 		 4106 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  51.14 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  37.14 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.73 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.3 
 
 		 1403 aa  70.1  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  35.47 
 
 		 1346 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  52.78 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  40.34 
 
 		 856 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.54 
 
 		 3427 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  44.33 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  32.22 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  38.82 
 
 		 3209 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  24.11 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  41.67 
 
 		 1502 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  54.67 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  52.44 
 
 		 5171 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  52.05 
 
 		 6753 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  39.06 
 
 		 4285 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  23.83 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  48.86 
 
 		 709 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  56.92 
 
 		 5962 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  42.53 
 
 		 7919 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  48.81 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  37.8 
 
 		 5769 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  27.19 
 
 		 908 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  44.32 
 
 		 7679 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  34.76 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  53.33 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  53.42 
 
 		 2542 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  50.6 
 
 		 759 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  50.68 
 
 		 8682 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  48.39 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  51.25 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  55.38 
 
 		 5218 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  42.02 
 
 		 998 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.16 
 
 		 8321 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  42.86 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  46.59 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.21 
 
 		 2704 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>