More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2363 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2363  diguanylate cyclase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.630601  normal  0.137832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2568  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4043  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 366 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.902956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  36.59 
 
 		 321 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.89 
 
 		 586 aa  117  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0431  hypothetical protein  40.32 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3061  GGDEF domain-containing protein  34.33 
 
 		 469 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0905  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6847  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 242 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.49 
 
 		 626 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.207218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 319 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3387  diguanylate cyclase  37.02 
 
 		 442 aa  111  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 376 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 318 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 324 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 324 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.66 
 
 		 598 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142292  normal  0.143257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 320 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.24 
 
 		 1254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0933  diguanylate cyclase  39.79 
 
 		 423 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 324 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 324 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  33.15 
 
 		 364 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1609  multisensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  36.71 
 
 		 944 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1999  GGDEF domain-containing protein  37.5 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1957  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.04 
 
 		 975 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1983  sensory box protein  37.06 
 
 		 1136 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3920  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00763336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0569  sensory box/GGDEF family protein  35.15 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3737  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0531  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2725  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.09 
 
 		 717 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.172089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3794  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.807786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.06 
 
 		 1098 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.04 
 
 		 761 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.43 
 
 		 1098 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.75 
 
 		 768 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.09 
 
 		 1098 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0807  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.58 
 
 		 803 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1219  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.89 
 
 		 792 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  35.43 
 
 		 459 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0076  diguanylate cyclase  38.25 
 
 		 444 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2695  hypothetical protein  35.06 
 
 		 835 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.72 
 
 		 695 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3170  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.47 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256904  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.78 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  37.42 
 
 		 451 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  37.2 
 
 		 768 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  37.2 
 
 		 768 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 396 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1887  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.57 
 
 		 1092 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3626  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 840 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 243 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1348  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  35.29 
 
 		 763 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.54 
 
 		 917 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  36.08 
 
 		 523 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0014  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.4 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.927772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3537  GGDEF family protein  37.97 
 
 		 393 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3776  diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 427 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.174701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.02 
 
 		 610 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66295  normal  0.802083 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.65 
 
 		 538 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.26 
 
 		 550 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06699  hypothetical protein  37.91 
 
 		 452 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 446 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1425  GGDEF domain-containing protein  37.34 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  33.75 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2171  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  34.91 
 
 		 730 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2730  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.59 
 
 		 591 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0590236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1981  PAS:GGDEF  35.09 
 
 		 730 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0548345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0983  GGDEF family protein  35.76 
 
 		 443 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.99 
 
 		 859 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.08 
 
 		 710 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1165  diguanylate cyclase  38.12 
 
 		 517 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3012  diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 428 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000172152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 357 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 407 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 325 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4425  GGDEF family protein  31.65 
 
 		 435 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1829  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.81 
 
 		 754 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000110456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 343 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  34.73 
 
 		 554 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1526  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.46 
 
 		 504 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  35.9 
 
 		 1057 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0331  diguanylate cyclase  37.75 
 
 		 318 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.35 
 
 		 560 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00077  Intracellular signaling protein (GAF,GGDEF,EAL domains)  36.32 
 
 		 866 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2600  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.56 
 
 		 978 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.861539  normal  0.836089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 316 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2079  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000777268  hitchhiker  0.0000000000000132313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  32.32 
 
 		 323 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  28.48 
 
 		 334 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3330  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 401 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 312 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  32.58 
 
 		 949 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0588  hypothetical protein  39.24 
 
 		 903 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4956  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.16 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0364888 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 354 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>