More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0263 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  890    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  76.87 
 
 		 439 aa  644    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 484 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.81 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.92 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.92 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  26.37 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.33 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.07 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.48 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.17 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.07 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.07 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.04 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.5 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.41 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 421 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 970 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.19 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1215  extracellular solute-binding protein  19.93 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000245671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.29 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.61 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>