147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1215 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1215  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 402 aa  834    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000245671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  22.53 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.46 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.97 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.98 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  20.75 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.29 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.47 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.88 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  20.11 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  20.11 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.49 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.55 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.49 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  20.15 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  22.01 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  20.26 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  18.37 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  19.94 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.14 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  20.36 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.58 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  20.5 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.16 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.28 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.51 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.83 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  20.45 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  19.54 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  19.3 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0263  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.962251  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  21 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 961 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  18.56 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.97 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>