More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0643 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 616 aa  1192    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  71.99 
 
 		 550 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  98.71 
 
 		 541 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1177 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  29.72 
 
 		 1055 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 771 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 1390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 839 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 875 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 559 aa  117  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 872 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 945 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 1253 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.83 
 
 		 895 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 215 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 382 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 874 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 1654 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 681 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 556 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 381 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.86 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.75 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  34.54 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1093 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1093 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 381 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 1714 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1560 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 3706 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 941 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 406 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 834 aa  108  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 864 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 526 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 1183 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 771 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 932 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.38 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.77 
 
 		 744 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.24 
 
 		 1668 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 964 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  25.68 
 
 		 918 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 871 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 815 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 488 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1210 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 657 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 674 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 366 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 347 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1676 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 1227 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.5 
 
 		 1663 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 767 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1211 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1182 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 913 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  36.16 
 
 		 366 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 387 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 366 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 878 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 325 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 819 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 334 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 453 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 494 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 572 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 662 aa  97.8  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 909 aa  97.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 585 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 945 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 682 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.2 
 
 		 1248 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.11 
 
 		 676 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 886 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  34.53 
 
 		 494 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 790 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1289 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  32.68 
 
 		 344 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>