254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1509 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  48.21 
 
 		 1582 aa  992    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1628 aa  3088    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  53.57 
 
 		 1213 aa  1046    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  40.25 
 
 		 1390 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.78 
 
 		 1145 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 		 2097 aa  352  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 		 4800 aa  346  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.73 
 
 		 1884 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.52 
 
 		 833 aa  280  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.24 
 
 		 1415 aa  261  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.6 
 
 		 2467 aa  252  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  27.66 
 
 		 3954 aa  213  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.39 
 
 		 1072 aa  209  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 		 4334 aa  209  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.63 
 
 		 2911 aa  205  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  31.98 
 
 		 764 aa  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.52 
 
 		 2807 aa  192  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 1079 aa  178  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.69 
 
 		 1544 aa  153  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 1764 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  29.16 
 
 		 2836 aa  139  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  27.96 
 
 		 1855 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  28.53 
 
 		 1400 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.27 
 
 		 2133 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.99 
 
 		 648 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.4 
 
 		 2954 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  27.51 
 
 		 1134 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.95 
 
 		 2678 aa  125  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  27.48 
 
 		 1133 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.47 
 
 		 556 aa  122  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  31.02 
 
 		 745 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.98 
 
 		 1112 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.17 
 
 		 3619 aa  119  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.02 
 
 		 3619 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.51 
 
 		 3608 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 2198 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.31 
 
 		 1112 aa  112  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  29.63 
 
 		 1286 aa  110  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 		 395 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 907 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 759 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  33.89 
 
 		 395 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.42 
 
 		 946 aa  100  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 574 aa  99.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 		 1971 aa  96.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  28.51 
 
 		 851 aa  95.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  31.72 
 
 		 1610 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.13 
 
 		 3209 aa  94  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  30.93 
 
 		 2950 aa  92  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.2 
 
 		 1236 aa  91.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.46 
 
 		 2775 aa  90.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.41 
 
 		 4687 aa  88.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1424 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.68 
 
 		 795 aa  87.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  34.68 
 
 		 462 aa  87  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.25 
 
 		 824 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  27.96 
 
 		 1363 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  25.91 
 
 		 1279 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  29.07 
 
 		 7284 aa  83.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  28.47 
 
 		 768 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25.84 
 
 		 4798 aa  80.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.38 
 
 		 1197 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  28.55 
 
 		 965 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  27.91 
 
 		 769 aa  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  25.78 
 
 		 1217 aa  77  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  27.68 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  34.16 
 
 		 1029 aa  74.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.16 
 
 		 1029 aa  75.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 1895 aa  73.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.45 
 
 		 2667 aa  73.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  24.02 
 
 		 3026 aa  73.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  34.33 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  36.24 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  30.63 
 
 		 1883 aa  72.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  25.86 
 
 		 1164 aa  72.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 1864 aa  72.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  39.68 
 
 		 2887 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  32.67 
 
 		 2567 aa  70.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  26.44 
 
 		 928 aa  70.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.57 
 
 		 1534 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  32.92 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  26.74 
 
 		 1499 aa  69.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.24 
 
 		 1019 aa  69.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 		 1532 aa  69.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  29.69 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  31.27 
 
 		 1610 aa  68.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  26.73 
 
 		 1156 aa  68.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  32.49 
 
 		 503 aa  68.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  32.09 
 
 		 535 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.63 
 
 		 860 aa  66.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.13 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.35 
 
 		 3427 aa  65.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  30.86 
 
 		 2105 aa  65.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  44.94 
 
 		 475 aa  65.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.09 
 
 		 535 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  26.7 
 
 		 396 aa  64.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  36.08 
 
 		 531 aa  64.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  31.48 
 
 		 998 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>