100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1899 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 794 aa  1638    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  43.08 
 
 		 793 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  39.97 
 
 		 833 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  41.5 
 
 		 791 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  42.17 
 
 		 716 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 815 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  37.11 
 
 		 803 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1311  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5745  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 691 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000026559  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.88 
 
 		 914 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 942 aa  91.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 958 aa  90.9  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  28.06 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.03 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1786  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57125  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.57 
 
 		 760 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  22.39 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 705 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  28.06 
 
 		 692 aa  56.6  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 777 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.1 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.82 
 
 		 768 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 815 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  29.93 
 
 		 704 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 680 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  28.1 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 715 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 729 aa  53.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 720 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  31.25 
 
 		 704 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 751 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 737 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 613 aa  52.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 659 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  26.11 
 
 		 702 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.44 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 678 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 798 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.12 
 
 		 766 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 780 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 707 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  26.67 
 
 		 821 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0305  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 805 aa  48.9  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 735 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 735 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  28.08 
 
 		 705 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.23 
 
 		 691 aa  48.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 768 aa  47.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 768 aa  47.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 868 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 770 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.6 
 
 		 750 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 808 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 614 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 710 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 358 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 702 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 774 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  22.46 
 
 		 695 aa  47  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  32.29 
 
 		 797 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 710 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  22.2 
 
 		 716 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.12 
 
 		 638 aa  45.8  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 705 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 713 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  36.67 
 
 		 691 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 711 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 747 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 887 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 742 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 753 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 656 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  25.68 
 
 		 846 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  22.63 
 
 		 683 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.6 
 
 		 1023 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 736 aa  45.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 671 aa  44.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.95 
 
 		 726 aa  44.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 682 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  22.99 
 
 		 788 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 772 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 743 aa  44.3  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 729 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  28.57 
 
 		 788 aa  44.3  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 841 aa  44.3  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 671 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 664 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  26.02 
 
 		 778 aa  44.3  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 602 aa  44.3  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 778 aa  44.3  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>