180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40695 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  100 
 
 
749 aa  1557    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  33.42 
 
 
791 aa  419  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  31.44 
 
 
1067 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  28.25 
 
 
938 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  27.26 
 
 
835 aa  225  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  28.39 
 
 
614 aa  224  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.46 
 
 
799 aa  223  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  25.82 
 
 
791 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  25.49 
 
 
793 aa  204  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  23.98 
 
 
782 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.07 
 
 
841 aa  180  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  23.39 
 
 
788 aa  177  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  24.96 
 
 
849 aa  173  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  30.32 
 
 
849 aa  165  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.06 
 
 
654 aa  97.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.79 
 
 
676 aa  92  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.53 
 
 
670 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.57 
 
 
550 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.62 
 
 
634 aa  88.6  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.36 
 
 
773 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.62 
 
 
669 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.69 
 
 
739 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  23.17 
 
 
790 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.84 
 
 
790 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.78 
 
 
777 aa  74.7  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.14 
 
 
712 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.81 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  23.89 
 
 
757 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.22 
 
 
774 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  28.19 
 
 
723 aa  65.1  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  23.82 
 
 
766 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  22.48 
 
 
855 aa  64.7  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  28.11 
 
 
722 aa  64.3  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  22.3 
 
 
855 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  28.04 
 
 
852 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.82 
 
 
619 aa  63.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  23.04 
 
 
766 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.76 
 
 
582 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.41 
 
 
756 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.01 
 
 
580 aa  62.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.71 
 
 
785 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.29 
 
 
723 aa  61.6  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  26.12 
 
 
541 aa  60.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24 
 
 
729 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  22.46 
 
 
754 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.64 
 
 
785 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  23.38 
 
 
745 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  22.18 
 
 
766 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  24.84 
 
 
739 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  26.74 
 
 
773 aa  57.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  22.07 
 
 
801 aa  57.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  33.02 
 
 
644 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  33.33 
 
 
640 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  25 
 
 
614 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.14 
 
 
806 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  26.07 
 
 
574 aa  56.6  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  22.8 
 
 
897 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  22.8 
 
 
897 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  34.62 
 
 
726 aa  55.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.15 
 
 
781 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.52 
 
 
758 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  32.35 
 
 
583 aa  54.3  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  21.68 
 
 
838 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  26.62 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  25.87 
 
 
766 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.44 
 
 
781 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  25.87 
 
 
766 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  26.62 
 
 
755 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  26.62 
 
 
755 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.38 
 
 
758 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  22.87 
 
 
667 aa  53.1  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  27.06 
 
 
790 aa  52.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  25.6 
 
 
537 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  25.24 
 
 
773 aa  52  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  38.14 
 
 
798 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  38.14 
 
 
798 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  25 
 
 
766 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
706 aa  51.2  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  25 
 
 
766 aa  51.2  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  20.43 
 
 
575 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.56 
 
 
787 aa  50.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.78 
 
 
716 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.78 
 
 
716 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.85 
 
 
720 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  24.85 
 
 
669 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  30.39 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  31.78 
 
 
807 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.67 
 
 
588 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  22.05 
 
 
669 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  32.14 
 
 
652 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  33.63 
 
 
775 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  34.58 
 
 
798 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  29.27 
 
 
669 aa  50.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  22.78 
 
 
716 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  22.78 
 
 
716 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.78 
 
 
762 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.93 
 
 
710 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  23.44 
 
 
537 aa  49.3  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.6 
 
 
957 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.78 
 
 
716 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>