205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0842 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  100 
 
 		 541 aa  1085    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  69.16 
 
 		 551 aa  720    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  32.89 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.64 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.31 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.13 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.43 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.13 
 
 		 510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  30.74 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  30.34 
 
 		 514 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  30.15 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.13 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.72 
 
 		 533 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  29.87 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  29.5 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  29.16 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  26.2 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.34 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  28.76 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25.39 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  26.85 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  27.39 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  27.8 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  27.69 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  26.44 
 
 		 1017 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  36.41 
 
 		 203 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.59 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  31.13 
 
 		 248 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  26 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  32.7 
 
 		 974 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  24.77 
 
 		 517 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.66 
 
 		 307 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.17 
 
 		 835 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  36.14 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  32 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.11 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  27.85 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  24.71 
 
 		 749 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  26.14 
 
 		 1078 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1079 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  24.56 
 
 		 982 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  25.55 
 
 		 1078 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  24.77 
 
 		 836 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.36 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  22.62 
 
 		 837 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  24.21 
 
 		 782 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  24.69 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  32.11 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  35.68 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  33.5 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  25.27 
 
 		 983 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.65 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.39 
 
 		 334 aa  67  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.93 
 
 		 536 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  23.47 
 
 		 805 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  29.23 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  23.57 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  26.87 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  27.06 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  23.74 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  23.06 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  28.33 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  27.76 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  26.23 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  28.33 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  26.2 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.3 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.83 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  30.73 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.95 
 
 		 844 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  24.89 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  24.89 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  27.23 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.81 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  29.35 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  28.28 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  25.57 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.49 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  33.04 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  30.34 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  30.26 
 
 		 286 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  28.49 
 
 		 520 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  28.7 
 
 		 339 aa  57  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  30.26 
 
 		 286 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  25.39 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  35.79 
 
 		 735 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  35.4 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  29.19 
 
 		 301 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  25.22 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  29.66 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  24.94 
 
 		 876 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  32.14 
 
 		 759 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  25.56 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  25.22 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  25.64 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.66 
 
 		 291 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  30.14 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  24.23 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>