More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0503 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 416 aa  800    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 423 aa  317  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  53.99 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  42.82 
 
 		 426 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  46.53 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  47.28 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  46.15 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  46.48 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  46.48 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  43.31 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  45.1 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  36.71 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  35.29 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.36 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  36.69 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  35.26 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.97 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  33.73 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.32 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.53 
 
 		 487 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.24 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  39.16 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  32.69 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  35.34 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  34.78 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  31.98 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  31.98 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  31.98 
 
 		 381 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  36.39 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  36.83 
 
 		 483 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.97 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.23 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  32.77 
 
 		 421 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.92 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  35.69 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  32.19 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  35.74 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  31.82 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  28.65 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  33.68 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.1 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  34.08 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  26.7 
 
 		 429 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  32.69 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  29.55 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  29.74 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.24 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.2 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.93 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 		 351 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.32 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  30.14 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  29.97 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.08 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 389 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.19 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.87 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.49 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.52 
 
 		 361 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.02 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  28.29 
 
 		 357 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.2 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.71 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.59 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  24.22 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.7 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.92 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  30.97 
 
 		 563 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.71 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.08 
 
 		 357 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  33.24 
 
 		 665 aa  94  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  28.91 
 
 		 363 aa  94  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.16 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.33 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.61 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.13 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.85 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.85 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>