221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1139 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3783  putative TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 428 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  38.89 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  35.14 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  37.88 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 415 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  41.27 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3771  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.179625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>