285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3322 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  61.97 
 
 
862 aa  983    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  64.29 
 
 
855 aa  1022    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  70.76 
 
 
862 aa  1111    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 
872 aa  1679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  42.73 
 
 
895 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  41.41 
 
 
1204 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  40.79 
 
 
1011 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  41.85 
 
 
1131 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  40.76 
 
 
1109 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  36.23 
 
 
874 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  33.14 
 
 
860 aa  343  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  32.99 
 
 
842 aa  337  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  31.52 
 
 
805 aa  320  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  30.78 
 
 
1359 aa  300  6e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.72 
 
 
923 aa  295  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  29.27 
 
 
832 aa  276  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  31.46 
 
 
879 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.28 
 
 
764 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.89 
 
 
778 aa  127  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.61 
 
 
748 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.48 
 
 
752 aa  119  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.92 
 
 
864 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.27 
 
 
755 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.58 
 
 
385 aa  111  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.33 
 
 
747 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  37.67 
 
 
380 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.9 
 
 
812 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  30.53 
 
 
385 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 
385 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  27.96 
 
 
388 aa  104  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  24.4 
 
 
755 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.29 
 
 
807 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  24.2 
 
 
752 aa  93.2  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  23.89 
 
 
777 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.58 
 
 
807 aa  92  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.53 
 
 
815 aa  91.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22.59 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  31.71 
 
 
835 aa  89.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  25.88 
 
 
825 aa  87.4  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.84 
 
 
687 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  28.3 
 
 
387 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.46 
 
 
778 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  27.07 
 
 
815 aa  77  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  30.41 
 
 
746 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.14 
 
 
895 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.78 
 
 
806 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  27.66 
 
 
1051 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.27 
 
 
920 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  26.74 
 
 
905 aa  73.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  36 
 
 
845 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.88 
 
 
899 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  27.22 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  27.56 
 
 
865 aa  72.4  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  29.73 
 
 
859 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.9 
 
 
1128 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  31.67 
 
 
839 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  20.26 
 
 
800 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.81 
 
 
898 aa  70.1  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  33.33 
 
 
862 aa  70.1  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  31.34 
 
 
777 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.41 
 
 
808 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  21.31 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  30.41 
 
 
758 aa  68.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.67 
 
 
882 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  35.4 
 
 
921 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  24.5 
 
 
791 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.6 
 
 
883 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.67 
 
 
882 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.96 
 
 
727 aa  67.4  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  25.11 
 
 
881 aa  66.6  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.67 
 
 
669 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.05 
 
 
882 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.14 
 
 
882 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.05 
 
 
756 aa  65.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26 
 
 
756 aa  65.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.33 
 
 
821 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  24.19 
 
 
865 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  21.69 
 
 
684 aa  64.7  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.31 
 
 
883 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22 
 
 
967 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  26.44 
 
 
821 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.2 
 
 
792 aa  64.3  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  24.04 
 
 
790 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  32.33 
 
 
1225 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  21.68 
 
 
877 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.42 
 
 
831 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.14 
 
 
1291 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  32.83 
 
 
889 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  29.8 
 
 
1287 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  26.35 
 
 
843 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  22.13 
 
 
790 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  29.12 
 
 
810 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  24.68 
 
 
767 aa  59.3  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.23 
 
 
828 aa  59.7  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.41 
 
 
893 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.47 
 
 
861 aa  58.9  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.52 
 
 
793 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  30.92 
 
 
889 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.04 
 
 
795 aa  58.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.23 
 
 
892 aa  58.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>