102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4767 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
951 aa  1923    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.96 
 
 
556 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.32 
 
 
1066 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  28.98 
 
 
583 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.09 
 
 
600 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.06 
 
 
604 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.43 
 
 
649 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.57 
 
 
546 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.07 
 
 
593 aa  131  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25.7 
 
 
668 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.93 
 
 
569 aa  129  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.15 
 
 
655 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.67 
 
 
577 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  29.3 
 
 
562 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  26.28 
 
 
667 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  26.61 
 
 
655 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  29.31 
 
 
604 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.23 
 
 
573 aa  121  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.59 
 
 
638 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.79 
 
 
1120 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.64 
 
 
1208 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.31 
 
 
658 aa  115  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.39 
 
 
1129 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 
620 aa  111  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.23 
 
 
645 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26 
 
 
1225 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.87 
 
 
1246 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.93 
 
 
677 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.87 
 
 
596 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  23.7 
 
 
1088 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.26 
 
 
1161 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.46 
 
 
657 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.45 
 
 
1183 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 
593 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.37 
 
 
1193 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.62 
 
 
1127 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  30.77 
 
 
328 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  24.05 
 
 
1203 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.99 
 
 
1228 aa  99  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.28 
 
 
585 aa  98.2  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.46 
 
 
1113 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  28.79 
 
 
730 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.37 
 
 
1098 aa  95.9  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  30.88 
 
 
305 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.32 
 
 
1172 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.09 
 
 
1109 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.53 
 
 
574 aa  91.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  29.29 
 
 
328 aa  90.9  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.52 
 
 
554 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  30 
 
 
409 aa  87.8  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  29.79 
 
 
320 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.83 
 
 
1208 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.7 
 
 
1114 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.28 
 
 
803 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  33.81 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  24.36 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.19 
 
 
1236 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.26 
 
 
1192 aa  84.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  25 
 
 
1126 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25.78 
 
 
1166 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.92 
 
 
1107 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  27.6 
 
 
345 aa  80.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.23 
 
 
1170 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.38 
 
 
1189 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.52 
 
 
1098 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  24.91 
 
 
339 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.13 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  27.54 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  29.62 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  29.72 
 
 
305 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  27.76 
 
 
305 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.39 
 
 
1226 aa  72  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.38 
 
 
737 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.6 
 
 
585 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
1127 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.62 
 
 
499 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.17 
 
 
566 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.15 
 
 
8871 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  22.93 
 
 
1575 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.67 
 
 
1040 aa  59.7  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.37 
 
 
691 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  25.84 
 
 
282 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  25.84 
 
 
282 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.69 
 
 
1275 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  27.09 
 
 
320 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27 
 
 
974 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.47 
 
 
573 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.41 
 
 
1490 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25 
 
 
1838 aa  51.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.95 
 
 
521 aa  50.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  30.19 
 
 
290 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  31.71 
 
 
277 aa  48.9  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  27.84 
 
 
274 aa  48.9  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  23.02 
 
 
685 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  23.02 
 
 
685 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25.69 
 
 
472 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.28 
 
 
655 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.62 
 
 
2807 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.37 
 
 
11716 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>