14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6359 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  68.88 
 
 
344 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  55.76 
 
 
345 aa  361  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  50.64 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  50.78 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  53.56 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  53.38 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  43.05 
 
 
305 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  45.55 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  45.79 
 
 
305 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  40.66 
 
 
409 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  38.87 
 
 
320 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.37 
 
 
951 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  25.32 
 
 
290 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>