15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4111 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  65.4 
 
 
339 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  62.09 
 
 
345 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  59.3 
 
 
328 aa  332  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  60.92 
 
 
353 aa  332  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  54.78 
 
 
328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  56.57 
 
 
320 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  47.43 
 
 
305 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  45.82 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  47.78 
 
 
409 aa  235  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  41.4 
 
 
320 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.86 
 
 
951 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  26.81 
 
 
290 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  27.91 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>