22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4566 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  63.35 
 
 
282 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  63.35 
 
 
282 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  55.87 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  54.38 
 
 
290 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  36.13 
 
 
277 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  35.56 
 
 
274 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  28.63 
 
 
951 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  27.44 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  30.43 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  29.48 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  28.71 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.33 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2594  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  23.89 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2628  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.26 
 
 
503 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.344262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  29.59 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.35 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  26.36 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  25.11 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0721  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.62 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  26.02 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.38 
 
 
338 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>