33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1982 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  56.34 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  54.38 
 
 
286 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  56.41 
 
 
282 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  56.41 
 
 
282 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  40.14 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  41.35 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  31.18 
 
 
951 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  26.88 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  28.69 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.23 
 
 
366 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  27.33 
 
 
305 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.8 
 
 
338 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  25.93 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  27.93 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  27.04 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.57 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.8 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  27.78 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  25.27 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.27 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.4 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  28.93 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.7 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0721  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.56 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  28.32 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  30.97 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  30.97 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  30.09 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0529  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.31 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  29.2 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.2 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  30.09 
 
 
349 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000941791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>